近來理財風氣盛行，營利事業為獲取利潤，利用閒置資金向金融機構申購國外基金作為投資，應特別注意，營利事業處分境外基金的所得，應與國內的營利事業所得合併申報課徵營利事業所得稅，不適用所得稅法第4條之1有關證券交易所得停止課徵所得稅的規定。
財政部南區國稅局表示，以基金公司的註冊地來區分，可分為境內基金及境外基金，
- 境內基金指的是基金的發行公司在國內登記註冊的基金，依所得稅法第4條之1規定，處分境內基金所發生的利得，屬證券交易所得，於證券交易所得停徵期間，免徵營利事業所得稅，但是應申報營利事業所得基本稅額；
- 而境外基金，係指基金的發行公司註冊地在我國以外的地區，由國外基金公司所發行，並經金融監督管理委員會證券期貨局核准在國內銷售的基金，營利事業處分境外基金的所得，屬於境外投資所得，並不屬於停徵證券交易所得稅的範疇，應依所得稅法第3條第2項規定併計營利事業所得額申報納稅。
該局特別提醒，境內外基金並不是以基金投資區域區分，而是以基金公司登記註冊地區分，營利事業於申報處分基金利得時，若無法區別境內外基金，可逕洽基金申購單位或上網至基金資訊觀測站（網址https://announce.fundclear.com.tw）查詢，以避免申報錯誤。
